Visi LPPM Unisa Yogyakarta yaitu menjadi Lembaga Penelitian dan Pengabdian Masyarakat yang berwawasan kesehatan, pilihan dan unggul berdasarkan nilai-nilai Islam
Misi LPPM Unisa Yogyakarta yaitu:
- Menyelenggarakan penelitian berbasis evidence based, berwawasan kesehatan dan berdasarkan nilai nilai Islam
- Menyelenggarakan pengabdian masyarakat secara komprehensif, terpadu, berkelanjutan berwawasan kesehatan dan berdasarkan nilai Islam
- Menyelenggarakan pertemuan ilmiah secara terpadu dan berkelanjutan
- Mengembangkan publikasi ilmiah baik nasional maupun internasional yang berwawasan kesehatan dan berdasarkan nilai-nilai Islam
- Menjadi pusat pelatihan pengembangan ilmu, penelitian dan pengabdian masyarakat
